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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 20221094079 9.7 (22)申请日 2022.08.06 (71)申请人 复旦大学 地址 200433 上海市杨 浦区邯郸路2 20号 (72)发明人 章琛曦 裘茗烟 宋志坚 许剑民 郑鹏 冯青阳 (74)专利代理 机构 上海正旦专利代理有限公司 31200 专利代理师 陆飞 陆尤 (51)Int.Cl. G06T 7/00(2017.01) G06N 3/04(2006.01) G06N 3/08(2006.01) G06T 7/11(2017.01) G06V 10/44(2022.01)G06V 10/75(2022.01) G06V 10/80(2022.01) G06V 10/82(2022.01) (54)发明名称 基于集成交叉伪标签的肿瘤 图像半监督分 割方法 (57)摘要 本发明属于医学图像处理技术领域, 具体为 一种基于集成交叉伪标签的肿瘤图像半监督分 割方法。 本发 明方法通过训练差异 较大的三个分 割模型: 基于Transformer架构的UNETR模型, 基 于CNN的注意力U ‑Net, 基于CNN的多尺度特征信 息的注意力分割网络模型CSA ‑U‑Net, 来生成无 标注数据的伪标签; 然后使用带伪标签的无标注 数据扩展训练数据, 通过伪标签数据交替监督约 束输出结果的一致性。 最后集 成多个模 型的输出 结果, 以提升分割模型的精度。 本发明方法可 以 更好地通过结合无标注数据和有标注数据的信 息直接提升模型分割性能。 权利要求书2页 说明书6页 附图2页 CN 115393289 A 2022.11.25 CN 115393289 A 1.一种基于集成交叉伪标签的肿瘤图像半监 督分割方法, 其特 征在于, 具体步骤为: (1)对MRI 图像进行预处理, 包括对图像进行强度归一化以及直方图均衡化, 把整个图 像分成一定数量的小块像素, 进行非线性拉伸, 使局部的灰度直方图均匀分布; (2)将预处理过后的图像作 为输入图像缩放输入至分割模型U ‑Net进行粗分割, 定位出 目标区域; 然后在输入图像中裁 剪出以目标区域 为中心的图像, 增大 前景像素的占比; (3)然后训练差异较大的三个模型构成的分割网络模型, 三个模型分别为: 基于 Transformer架构的U NETR模型, 基于CNN的注意力U ‑Net, 基于CNN的多尺度特征信息的注意 力分割网络模 型CSA‑U‑Net; 用来生 成无标注数据的伪标签; 然后使用带伪标签的无标注数 据扩展训练数据, 通过伪标签数据交替 监督约束输出 结果的一 致性; (4)将所裁剪出的目标区域输入训练好分割网络模型中, 集成多个模型的输出结果, 得 到高精度分割结果。 2.根据权利要求1所述的肿瘤图像半监督分割方法, 其特征在于, 所述注意力U ‑Net是 在U‑Net的基础上在跳跃 连接中加入了注意力门控 模块; 所述多尺度特征信息 的注意力分割网络模型CSA ‑U‑Net是在U ‑Net的基础上加入了注 意力门控模块, 将解码 器中较粗尺度l ‑1层的卷积特征作为门控信号来选择编码 器l层中特 征图的空间区域, 即在全局范围计算注意力系 数以识别显著图像区域, 并修剪特征响应以 仅保留与特定任务相关的激活; 然后再将经过筛选的特征图与相应l层解码器精细密集预 测特征图拼接融合, 以更好地辅助解码器进 行目标定位与恢复; 利用多尺度信息, 在解码阶 段导出不同尺度的特征图进行预测, 即在计算损失函数的过程中嵌入不同尺度的空间语义 信息, 以更好 地监督模型的训练; 所述基于Transformer架构的UNETR模型的编码结构由堆叠的纯Transformer模块组 成, 解码结构与U ‑Net架构相似, 通过两层3 ×3×3卷积操作, 并使用反卷积对其输出进行上 采样, 直到特征图回复到原始的输入的分辨率; 最后通过具有Softmax激活的1 ×1×1卷积 层输出最终的分割预测结果。 3.根据权利要求2所述的肿瘤图像半监督分割方法, 其特征在于, 所述预处理后的图像 中, 将有标注数据输入到三个差异较大的分割网络模型中, 通过训练得到三个分割模型; 然 后将无标注数据输入到训练后的三个分割模型中, 三个模型分别输出三个预测概率结果 P1、 P2、 P3, 分别通过最大值的参数操作得到对应的独热编码标签Y1、 Y2和Y3; 假设验证集结 果最好的模型为模型f( θ3), 次优为模型f( θ2), 则将f( θ3)所输出的伪标签Y3来监督其他两 个模型的预测概率结果, 而f( θ2)的伪标签Y2来监督P3, 从而最大限度降低伪标签中的噪 声; 然后对三个模型均进行反向传播迭代优化。 4.根据权利要求3所述的肿瘤图像半监督分割方法, 其特征在于, 所述嵌入不同尺度的 空间语义信息时, 采用三阶样条插值法将所有体素重新采样为统一大小。 5.根据权利要求4所述的肿瘤图像半监督分割方法, 其特征在于, 模型训练中, 损 失函 数采用Dice与交叉熵损失函数组合即LDice+LCE, 总损失值为有标注数据与无标注数据的损 失值之和, L oss=L有 标注+α L无标注, 其中α 表示权 重。 6.根据权利要求5所述的肿瘤图像半监督分割方法, 其特征在于, 模型训练中, 采用优 化算法Adabound进行迭代优化, 权重不断更新, 损失值逐渐下降, 最 终训练完成目标任务的 分割网络模型。权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 115393289 A 27.根据权利要求2所述的肿瘤图像半监督分割方法, 其特征在于, 所述在每次训练迭代 中对输入图像进行包括随机 旋转、 剪切、 缩放和翻转操作的随机变换以增强数据。 8.根据权利要求2所述的肿瘤图像半监督分割方法, 其特征在于, 所述集成多个模型的 输出结果, 是在基于验证集最好的模型输出的基础上, 遍历所有体素, 当某个体素在另外两 个模型中预测为1, 而最优模型预测为0的时候, 改变输出的结果为1; 集成多个结果后得到 最终的分割结果。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 115393289 A 3
专利 基于集成交叉伪标签的肿瘤图像半监督分割方法
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